Bu konu hakkında
Dr. Öğretim Üyesi Onur Tokgün açıklamalarda bulundu ; SARS-CoV-2 virüsünün bulaşma modellerini ve
moleküler evrimini anlamak, hastalıkların önlenmesi için etkili ilaçlar ve
aşılar üretmek için çok önemlidir. Bu nedenle, koronavirüslerin genomik
dizilerinin analizleri, ilaç / aşı tasarımı için temel araçları
oluşturmaktadır. Dünya genelinde virüs genom dizilerinin paylaşıldığı (GISAID)
veri tabanında
( https://www.gisaid.org/epiflu-applications/hcov-19-reference-sequence) 1,448,566 SARS-CoV-2
tam genom dizisi bulunmaktadır. GISAID veri tabanından dünyanın her bölgesinden
fazlasıyla SARS-CoV-2 genomu bulunmasına rağmen DENİZLİ ilimizden örnek
bulunmamakta idi. Üniversitemiz Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinasyon
Birimi tarafından Hızlı Destek projesi olarak desteklenmiş bu projemizde
Denizli ilinden 15 adet Türk hasta örneğinden izole edilmiş SARS-CoV-2 genomu
tam genom dizilerini ortaya çıkarmak için yeni nesil sekanslama (NGS) analizi
gerçekleştirildi. Başarı ile tamamladığımız çalışmamız The Journal of Infection
in Developing Countries (JIDC) dergisinde bilimsel yayın olarak kabul gördü.
Çalışmamızda genetik benzerliklerini belirlemek için, Türkiye'deki SARS-CoV-2
genomlarının tamamı ve GISAID'den seçilen dünya çapındaki izolatlar dikkate
alınarak filogenetik analizler yapılmıştır. Ayrıca, SARS-CoV-2 genomlarındaki
mutasyonları göstermek için varyasyon analizleri de gerçekleştirilmiştir. Tüm
deneysel ve biyoinformatik analizlerin tarafımızdan Tıbbi Genetik Anabilim
Dalımızda gerçekleştirilen bu çalışmamızda veri tabanlarında % 0,01-0,03
sıklıklarında gözlenen nadir mutasyonlar saptanmıştır.
Dr.
Tokgün gerçekleştirdikleri çalışmanın
gerek ilaç ve aşı tasarımı gerekse hastalığın seyrinin bölgesel
farklılıklarının yorumlanmasında katkı sağlayacağını düşünmekte olduklarını da
söyledi.